Es sind 6 Monate vergangen und im Leben von Nanoha gehen alle Dinge ihren normalen Verlauf. Vor einem halben Jahr hat sie herausgefunden, dass sie magische Kräfte besitzt und sammelte mit ihrem Freund Yuuno die „Jewel Seeds“ bevor sie in die falschen Hände gerieten und Schaden anrichten. In diesen Teil der Serie geht es nicht um „Jewel Seeds“, sondern um das Buch der Dunkelheit. Dessen „Herrin“ ist ein unschuldiges Mädchen namens Hayate, welche an den Rollstuhl gefesselt ist, da sie von ihrer Hüfte an gelähmt ist. Allerdings weitet sich die Lähmung aus. Die Eltern von Hayate starben vor Jahren und seitdem lebt sie alleine in einem großen Haus, bis das Buch „erwacht“. Mit dem Buch erwachen auch die vier Wolkenritter. Deren Namen sind Signum, Shamal, Vita und Zafira und sie müssen den Anweisung ihrer „Herrin“ folgen.
Die Aufgabe der Wolkenritter ist es die Seiten des Buches der Dunkelheit zu füllen, in dem sie den „Linker Core“ von magischen Opfern nehmen. Wenn das Buch gefüllt ist erlangt die „Herrin“ absolute Macht. Die Wolkenritter haben bemerkt, dass das Buch für Hayates Lähmung verantwortlich ist und stellen sich so gegen ihre Anweisungen und füllen die Seiten des Buches. Währenddessen ist Fates Gerichtsverhandlung vorbei und sie wurde als unschuldig erklärt. Ihr wurde ein Zuhause bei Admiral Lindy und Chrono angeboten. Diese drei, sowie Nanoha, Yuuno und Arf arbeiten zusammen, um die Vervollständigung des Buches zu verhindern. Sehr zum Missfallen der Wolkenritter. Werden es Nanoha und ihre Freunde schaffen die Wolkenritter zu stoppen, bevor es zu spät ist? Wenn nicht, was wird passieren, wenn das Buch vervollständigt ist?
Episodenübersicht:
Spoiler:
1 - Der Anfang kam nur allzu plötzlich. 2 - Sturm des Kampfes, wieder einmal. 3 - Wiedervereinigung und ein Umzug! 4 - Neue Kräfte, los gehts! 5 - Es war ein kleiner Wunsch (Teil 1) 6 - Es war ein kleiner Wunsch (Teil 2) 7 - Mit zerstörter Vergangenheit und Gegenwart. 8 - Ein trauriger Entschluß und eine mutige Wahl. 9 - Heiligabend. 10 - Schicksal. 11 - Ein Geschenk zu Weihnachten. 12 - Ende des Abends, Ende der Reise. 13 - Stand by, ready!
